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基因相互作用網(wǎng)絡圖

Demo 結(jié)果

Demo 結(jié)果

結(jié)果解讀

上圖中節(jié)點的大小表示的是基因的 degree,顏色代表上下調(diào)的信息,邊的顏色或者線型代表是相互作用的來源。


基因相互作用網(wǎng)絡圖介紹

基因網(wǎng)絡是一組基因的集合體,這些基因通過相互協(xié)作來控制生物體重要的生命過程。我們將客戶關(guān)注基因進行基于實驗驗證,其他親緣物種數(shù)據(jù)庫檢索、文獻挖掘等多種信息進行基因互作網(wǎng)絡的構(gòu)建,找到關(guān)鍵核心基因。

分析要求

客戶關(guān)注的 mRNA(如差異基因)。

提供結(jié)果

1、圖片文件(Network 圖),包括 png,PDF 格式;

2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打開進行細節(jié)調(diào)整;

3、文本文件:基因之間的互作關(guān)系,關(guān)鍵調(diào)節(jié)基因的排序(如 betweenness centrality)。

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