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功能層次網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

Demo 結(jié)果

系統(tǒng)地概括富集的基因所指向的功能類型以及分層關(guān)系

結(jié)果解讀

圖中從全局角度,系統(tǒng)地概括富集的基因所指向的功能類型以及分層關(guān)系。


功能層次網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建(GO-Network)介紹

基于 GO 的層次結(jié)構(gòu),將所有差異基因同時(shí)參與的顯著性 GO 及其相互從屬關(guān)系構(gòu)建功能網(wǎng)絡(luò),從全局角度,系統(tǒng)地概括功能間相互作用關(guān)系及所屬分層關(guān)系。

分析要求

GO 富集分析的結(jié)果或者多個(gè)感興趣的 GO(GO 個(gè)數(shù)大于 10)。

提供結(jié)果

1、圖片文件(Network 圖),包括 png,PDF 格式;

2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打開(kāi)進(jìn)行細(xì)節(jié)調(diào)整;

3、文本文件:GO 之間的從屬關(guān)系以及每個(gè) GO 對(duì)應(yīng)的 degree。

-END-


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