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時(shí)間序列共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)

Demo 結(jié)果

demo 結(jié)果

結(jié)果解讀

網(wǎng)絡(luò)圖為篩選出的核心基因之間的關(guān)系,通過(guò)圖論的方法計(jì)算出關(guān)鍵基因,并通過(guò)關(guān)鍵基因的共表達(dá)基因預(yù)測(cè)出其功能。


時(shí)間序列的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)介紹

根據(jù)基因表達(dá)信號(hào)值隨著時(shí)間序列的變化,計(jì)算基因間的共表達(dá)關(guān)系,得到基因間的表達(dá)調(diào)控關(guān)系及調(diào)控方向,從而構(gòu)建基因的表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。利用此網(wǎng)絡(luò)圖,研究者可通過(guò)分析基因調(diào)控能力,獲得樣本在時(shí)間過(guò)程中起調(diào)控作用的基因。

分析要求

時(shí)間,濃度,邏輯變化的樣本的差異基因,趨勢(shì)分析篩選的基因或關(guān)注的基因。

提供結(jié)果

1、圖片文件(Network 圖),包括 png,PDF 格式;

2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打開(kāi)進(jìn)行細(xì)節(jié)調(diào)整;

3、文本文件:基因之間共表達(dá)相關(guān)性以及顯著性,基因核心共表達(dá)的排序。

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