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IPA—Canonical pathways analysis

Demo 結果

DEMO 分析結果圖

結果解讀

從 IPA 的 pathway 富集結果中不僅可以看到 pathway 的富集顯著性,并且可以得到 pathway 的激活抑制的信息。


IPA—Canonical pathways analysis 介紹

通過 IPA 的 Ingenuity? Knowledge Base 數(shù)據(jù)庫,進行 Fisher 高精度檢驗得到具有顯著性意義的 pathway。運用客戶特定的實驗結果來計算每個 pathway 的 z -score 值預測 pathway 激活或者抑制。

分析要求

1、差異 mRNA 或者關注的 mRNA 基因集;

2、物種限于人,大鼠,小鼠;

3、每個基因有對應的差異倍數(shù)。

提供結果

1、圖片格式:pathway 柱狀圖;

2、文本格式:pathway 的富集結果。

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