scRNA-seq + bulk RNA-seq
一份價格 - 兩種服務 - 更好結果
活動規(guī)則
簡述：
單個項目滿 6 個樣本及以上； 單細胞樣本數(shù)等于轉錄組測序； 合同金額 80% 到款即刻享受。
詳述：
1. 活動中單細胞測序（scRNA-seq）指的是基于 BD 或 10X 平臺的單細胞 RNA 測序，轉錄組測序指的是常規(guī) mRNA 測序（bulk RNA-seq)；
2. 單細胞測序項目滿 6 個樣本起送同樣樣本及同樣樣本數(shù)轉錄組測序，即單細胞測序 6 個樣本送 6 個同樣樣本常規(guī) mRNA 測序，依此類推；
3. 活動期限內簽訂單細胞測序服務合同，且預付 80% 到款后，享受轉錄組測序免費服務；
4. 參與活動項目常規(guī) mRNA 測序數(shù)據(jù)量≤6G/ 樣本；
5. 本活動不與伯豪生物其他優(yōu)惠活動共享
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國自然真香 CP
< 單細胞測序 + 轉錄組測序 >
1. 常規(guī)轉錄組測序可以幫助獲得樣本的基本轉錄組信息，可以作為單細胞測序的預實驗：
來自北大張澤民課題組在 2017 年發(fā)表在 cell 上關于單細胞測序分析肝癌 T 淋巴細胞浸潤，以及 2019 年發(fā)表在 cell 上關于肝癌的單一免疫細胞的動態(tài)景觀圖的研究中，除了運用 Smart-seq2 和 10X genomeics 技術進行單細胞測序之外，還運用的 bulk RNA-seq 技術檢測了肝癌組織整體的轉錄水平，以及初步評估樣本中細胞的類別。
2. 兩種測序結果相互印證：
來自 Charmaine 團隊在 2018 年發(fā)表在 cell stem cell 上的關于 IPSC 誘導多能干細胞分化的神經(jīng)元的單細胞測序的研究中，作者同時從 PD 病人中分離 IPSC 并誘導分化成多巴胺神經(jīng)元，和從正常人中分離 IPSC 并誘導分化成多巴胺神經(jīng)元。對分化的神經(jīng)元同時進行了 Smart-seq 的單細胞測序，以及 bulk RNA-seq。結果發(fā)現(xiàn)，bulk RNA-seq 也可以清楚的發(fā)現(xiàn)，PD 病人和正常人的 IPSC 誘導得到的多巴胺神經(jīng)元在整體轉錄水平上存在差異，且這些差異主要集中在與神經(jīng)元發(fā)育和突出活動相關的功能上。
3. bulk RNA 測序可以襯托單細胞測序的優(yōu)勢：
來自 li 團隊與 2017 年發(fā)表在 nature genetics 上的關于結直腸癌組織和正常粘膜組織的單細胞測序研究中，作者展示了單細胞測序和 bulk RNA 測序在篩選差異基因方面的區(qū)別。研究發(fā)現(xiàn)，通過常規(guī)轉組測序無法得到的差異基因，而通過單細胞測序可以發(fā)現(xiàn)這些基因在癌組織和正常組織的特定的細胞類群中是存在顯著差異的。比如（下圖），與 EMT（上皮間質轉化）相關的基因只在成纖維細胞這個類群中存在差異。
為什么要選擇：伯豪生物單細胞測序服務？
伯豪生物經(jīng)過 6 年的積累，基于 SMART-seq，10X genomics 和 BD Rhapsody 的單細胞 RNA 測序服務平臺，為客戶提供從樣本保存、運輸、單細胞懸浮液制備，到單細胞分選、建庫、和數(shù)據(jù)分析的一站式解決方案，目前已為來源于人、小鼠、大鼠、果蠅、斑馬魚、牛、羊等物種的樣本提供了單細胞測序和數(shù)據(jù)分析服務，研究成果發(fā)表在 Cell Research、Nature Neuroscience 等雜志上。
參考文獻
1.Zheng, Chunhong, et al."Landscape of infiltrating T cells in liver cancer revealed by single-cell sequencing." Cell 169.7 (2017): 1342-1356.）
2.Zhang Q, He Y, Luo N, et al. Landscape and dynamics of single immune cells in hepatocellular carcinoma[J]. Cell, 2019, 179(4): 829-845. e20.
3.Lang, Charmaine, et al."Single-cell sequencing of iPSC-dopamine neurons reconstructs disease progression and identifies HDAC4 as a regulator of parkinson cell phenotypes." Cell stem cell 24.1 (2019): 93-106.）
4.3. Li, Huipeng, et al."Reference component analysis of single-cell transcriptomes elucidates cellular heterogeneity in human colorectal tumors." Nature genetics 49.5 (2017): 708.）
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